EERA tudományos munkája és különösen az ECER konferencia hálózatokban szerveződik. Bármely tudományterületen vagy oktatáskutatáson belül fókuszál a feladataira, amely jelenleg ott 25 hálózatban történik. Mindez összekapcsolódik az ECER konferencia rendezvényeivel valamint az Emerging Researchers Group-pal (ERG). Az ERG szervezi az évi Emerging Researchers Conference-t és törekszik a kutatói integráció megkönnyítésére az EERA hálózatok egyikébe.

A következő hálózatokkal lehetséges az együttműködés:

1. Továbbképzés, professzionális fejlesztés: tudásközvetítés egyéneknek, vezetőknek, és szervezetek
2. Szakképzés és tréning (VETNET)
3. Tantervi megújítás, magújulás
4. Globális nevelés, oktatás
5. Veszélyeztetett gyerekek és fiatalok és az oktatás
6. Szabad tanulás: média, környezet és kultúra
7. Társadalmi igazságosság és az interkulturális oktatás
8. Egészségügyi oktatással kapcsolatos kutatás
9. Értékelés, értékelés, tesztelés és mérés
10. Tanárképzés-kutatás

11. Nevelési hatékonyság és minőségbiztosítás
12. LISnet – a könyvtár és informatika / hálózatépítés
13. Az oktatás filozófiája
14. Közösségek, családok, és neveléskutatás
15. Európai kutatási partnerség
16. ICT az oktatásban és a képzésben
17. Neveléstörténet
18. Sportpedagógiával kapcsolatos kutatás
19. Néprajz
20. Kutatási innováció és interkulturális tanulási környezetek

22. Felsőoktatással kapcsolatos kutatás
23. Politikatanulmányok és az oktatás politikája
24. A matematikaoktatás kutatása
25. Oktatási,- és gyermekjogok kutatása
26. Oktatásirányítás
27. Oktatáselmélet – tudás és tanítás